No creo que la cantidad o tamaño sea tu problema, yo tengo instaladas más o menos unas 700 rutas con 781Gbs de Assets y siempre que no me ha arrancado el simulador ha sido por algún problema en alguna ruta. Normalmente la última instalada o modificada en mi caso, ha sido la culpable.
Me he encontrado alguna vez que el problema han sido 2 escenarios con el mismo identificador. La herramienta
RWDBFDup te puede ayudar a detectarlo.
Cuando el culpable del "cuelgue" del simulador ha sido un Asset, siempre ha sido a la hora de cargar una ruta o de listar el material rodante en el selector del editor de escenarios o en el menú QuickDrive. Pero siempre con el simulador ya en marcha.
Ayúdate a detectar el fallo con la herramienta LogMate.exe (en la carpeta RailWorks), en alguna ocasión me ha dado pistas de por dónde puede venir el problema.
Suerte!!